İskenderun Gümrük ve Muhafaza Başmüdürlüğü, 23.07.1939 Tarihinde Hatay’ın Anavatana İlhakı edildiği yılda kurulmuş olan, Türkiye’de İstanbul ve İzmir’den sonra kurulmuş olan üçüncü Başmüdürlük olduğunu belirten İTSO Başkanvekili Bülent Seküçoğlu “Gümrük ve Muhafaza Başmüdürlükleri, Gümrük ve Ticaret Bölge Müdürlükleri olarak teşkilatlandırıldıktan sonra, ilçe merkezlerinde olamayacağı iddiasıyla, İskenderun Gümrük ve Muhafaza Başmüdürlüğünün, İskenderun’dan taşınması kabullenilemez. İskenderun Limanın özelleştirme kapsamında devrinin gerçekleşmesinden, yeni kurulmuş, kurulmakta olan ve yatırım planlaması yapılan, özellikle demir çelik sanayi tesislerinin de üretime geçmesi ile birlikte, İskenderun da gerçekleştirilecek dış ticaret hacmi daha da artacaktır. Gümrük ve Ticaret Bölge Müdürlüklerinin İlçe Merkezlerinde olamayacağı iddiasının herhangi bir Kanuni Dayanağı yoktur. Bu sav, İzmit Gümrük ve Muhafaza Başmüdürlüğünün, İzmit’ den 06.05.2011 tarihinde gerçekleştirilen törenle, Derince ilçesine taşınması ile bizzat Bakanlık tarafından çürütülmüştür. Yeni Oluşturulacak Gümrük ve Ticaret Bölge Müdürlüğünün, icraatın gerçekleştiği İskenderun’dan taşınmasının, bu bölgede bulunan idari ve mükellef sorunların çözümüne hiçbir faydası olamayacaktır. Aksine her türlü ihtilafın ve sorunun çözümünü de zorlaştıracaktır. İskenderun İlçesinin ekonomik, jeopolitik ve sosyal konumu nedeniyle, İskenderun’ da bulunan Gümrük ve Muhafaza Başmüdürlüğünün, bölgemizde dış ticaretin kalbi konumunda bulunan, İskenderun’da kurulması ve bulunması zorunludur. Konuyla ilğili olarak bakanlıklar düzeyinde yazaşmalarımız başladı ve önümüzdeki günlerde bakanlarla görüşmek üzere Ankaraya da gidilecektir. Artık İskenderun’dan bir tek kurumun dahi gitmemesi için var gücümüzle çalışacağız”dedi.